Duplicaciones segmentarias (2004-2007)

El proyecto de salud humana "Duplicaciones segmentarias en alteraciones neurológicas del desarrollo neuronal y de la conducta" fue una iniciativa entre Genome Canada y Genoma España.

PARTICIPACIÓN
Investigadores	18	18
Grupos de investigación	4	3
Instituciones públicas	4	3
Compañías	1	-

Objetivos del proyecto

1. Mejorar el conocimiento sobre la organización genómica de las duplicaciones segmentarias (SD).
2. Desarrollar herramientas moleculares para el análisis de variabilidad genómica y su relación con enfermedades.
3. Evaluar la frecuencia de variantes de número de copia (CNV) y la variabilidad en la organización de las SD en poblaciones humanas.
4. Explorar la relación entre SD, CNV y enfermedad.
5. Estudiar mediante genómica comparada la organización de las SD e identificar estados ancestrales de los CNV entre humanos y primates.
6. Evaluar la participación de las SD en la variabilidad en el número de copia de genes y definir la relación entre los niveles de la expresión los mismos y enfermedades humanas.

Resultados más importantes alcanzados

• La identificación de la duplicación recíproca del locus delecionado en el síndrome de Williams-Beuren y el descubrimiento de que el gen NCF1 está estrechamente relacionado con el riesgo de hipertensión arterial en casos de dicho síndrome.
• El desarrollo de un chip de ADN interroga regiones causantes de síndromes humanos en los que están implicados SD y CNV.
• La identificación de 1447 regiones del genoma humano que son polimórficas en CNV y que se asocian ampliamente a SD.
• Los CNV abarcan un gran número de genes implicados en enfermedades como el SIDA o el lupus eritematoso diseminado.
• El descubrimiento de diversos reordenamientos presentes en muestras de retraso mental y autismo ligado al cromosoma X, conteniendo genes potencialmente responsables de dichas patologías.
• La determinación de influencia de las SD y CNV en la variabilidad de expresión de múltiples genes en distintos tejidos humanos y de primates, y en distintas poblaciones.
• El estudio de 200 CNV más comunes en 1051 individuos que conforman el panel de diversidad humana de CEPH, con la finalidad de establecer su distribución poblacional, estabilidad meiótica y heredabilidad.
• El estudio con aCGH de muestras con diagnóstico homogéneo y/o extremo de distintas patologías psiquiátricas y neurológicas, incluyendo esquizofrenia, trastorno bipolar, depresión mayor, trastorno de pánico, entre otros.
• El estudio del número de copia de genes localizados en CNV (~200) en más de 2000 muestras de patología psiquiátrica.
• El desarrollo de un test de diagnóstico, sobre el descubrimiento de diversos reordenamientos presentes en muestras de retraso mental y autismo ligado al cromosoma X, conteniendo genes potencialmente responsables de dichas patologías, ha dado pie a la creación de una patente por lado español.
• Fruto del proyecto es la creación, por parte española, de la empresa q-Genomics, que presta servicios de diagnóstico de muchas enfermedades a los servicios sanitarios estatales, mediante un microarray desarrollado en el seno del proyecto.

Indicadores de éxito

Contactos

Dr. Stephen W. Scherer Coordinador del proyecto Dept. of Genetics and Genomic Biology The Hospital for Sick Children 555 University Ave., Room 9107 M5G 1X8 Toronto Ontario, CANADA TEL: +1 (416) 813-7613 TEL: +1 604-822-5708 FAX: +1 (416) 813-8319 steve@genet.sickkids.on.ca

Dr. Xavier Estivill Coordinador del proyecto Programa de genes y enfermedad Coordinador del programa Centro de Regulación Genómica Dr. Aiguader, 88 08003 Barcelona ESPAÑA TEL: +34 93 316 01 59 FAX: +34 93 316 00 99 xavier.estivill@crg.es