Grapegen (2003-2007)

Genoma España en colaboración con Genome Canada lanza una convocatoria conjunta a gran escala, por la que pretenden financiar un proyecto de investigación sobre la genómica de plantas, denominado "Aproximación genómica a la identificación de los componentes genéticos y ambientales relacionados con la calidad de la uva en vid", GrapeGen.

PARTICIPACIÓN
Investigadores	6	19
Grupos de investigación	4	6
Instituciones públicas	4	6
Empresas	-	-

Objetivos del proyecto

1. Desarrollo de recursos genómicos que permitan el descubrimiento de los genes, proteínas y metabolitos asociados con los caracteres de calidad de la uva.
2. Desarrollo de herramientas genéticas y moleculares para el análisis de la función molecular y del efecto biológico de los genes identificados.
3. Dilucidar las rutas metabólicas y de desarrollo responsables de la calidad del fruto y los efectos que las interacciones entre genotipo y ambiente tienen sobre ellas.

Resultados más importantes alcanzados

• El desarrollo del GrapeGen-Chip que se va a utilizar para estudiar la respuesta del proceso de maduración de la uva a las condiciones de cambio climático, y de igual forma podría servir para el diagnóstico de la patología de la planta bien producida como resultado de situaciones de estrés biótico o abiótico.
• Con el mismo GrapeGen-Chip también se va a valorar la posibilidad de utilizar las diferencias de expresión entre distintas variedades como marcadores moleculares en estudios de ligamiento.
• El GrapeGen-Chip es la herramienta básica en estudios de control genético cuantitativo de la expresión génica que tratan de profundizar en el conocimiento de la estructura genética de caracteres de relevancia en la uva como la acidez y la textura.
• Se está utilizando también el GrapeGen-Chip para la identificación de genes candidatos responsables de variaciones somáticas de interés en la biología de la vid o en su explotación varietal. Así, está permitiendo identificar genes candidatos de la variación en el contenido de resveratrol en variedades blancas, para la variación en el desarrollo reproductivo en variantes somáticas derivadas de Cariñena o en el desarrollo de la hoja en Chasselas ciutat.
• Los datos de genotipos y fenotipos de las variedades de uva de mesa recogidas en los bancos de germoplasma españoles van a formar parte de una base de datos, que sirve de referencia para la selección de parentales en programas de mejora genética, la identificación de germoplasma desconocido o para estudios sobre la biología de los caracteres de calidad de la uva.
• Se está utilizando ya esta base de datos para la selección de colecciones que presentan la máxima variación para caracteres relacionados con distintos aspectos del desarrollo reproductivo.
• El desarrollo de una base de datos de proteínas de maduración que permite obtener marcadores proteicos de distintos estados del proceso para evaluar el desarrollo y maduración de las bayas.
• A partir de los SNP desarrollados en el proyecto se ha propuesto la selección de un juego de 48 para identificación genética y la creación de una base de datos pública que contenga esta información y que facilite y abarate la identificación genética de cualquier genotipo o su certificación.
• El conjunto total de SNP desarrollados en el proyecto, junto con los desarrollados en otros laboratorios que permitan llegar a unos 2000, podrían constituir una herramienta de mapeo de aplicación en cualquier población de vid.
• El desarrollo de la Web y base de datos de GrapeGen, que será alojada muy pronto en el servidor del CSIC.
• El interés mostrado por la Junta de Andalucía para iniciar programas de mejora genética en vid.
• El reconocimiento de la importancia de la vid a nivel nacional se constata en la apuesta de creación de un Instituto Mixto del CSIC-UR-Gobierno de la Rioja, de Investigación en Vid y Vino.

Indicadores de éxito

Transferencia tecnológica

La relevancia de la investigación genómica de la vid ha sido asumida por los propios inversores, empresas y agencias financiadoras, y los resultados de GrapeGen se reflejan en distintas áreas de actividad, financiadas por convocatorias europeas y nacionales, e inversión privada, como las siguientes:

• El Consortium ERA-PG 074B GRASP GRAPE WINE, compuesto por 17 instituciones públicas y privadas europeas.
• Propuesta de proyecto DEMETER para el CENIT 2008 del Programa Ingenio, liderado por las Bodegas Miguel Torres, SA, en el que participan 27 empresas del sector repartidas a nivel nacional.
• CAJAMAR, uno de los socios financiadores del proyecto, apuesta por licenciar (no en exclusiva) la explotación comercial de las herramientas genómicas, de aplicación en la mejora genética y en el desarrollo de nuevas variedades de uva de mesa, generadas en el seno del proyecto, a la empresa Savia Biotech de la que es socio mayoritario.

Contactos

Dr. Steven T. Lund Coordinador del Proyecto Viticulture/Plant Genomics Wine Research Centre The University of British Columbia 241 - 2205 East Mall Vancouver, BC, V6T 1Z4 CANADA TEL: +1 604-822-5708 FAX: +1 604-822-5143 stlund@interchange.ubc.ca

Dr. José Miguel Martínez Zapater Coordinador del Proyecto Dpto. Genética Molecular de Plantas Centro Nacional de Biotecnología – CSIC Universidad Autónoma de Madrid C/Darwin, 3 28049 Cantoblanco, Madrid, ESPAÑA TEL: +34 9158545687 FAX: +34 915854506 zapater@cnb.uam.es